Estudio de dos inventarios postmortem de 1818 y 1834 y edición de la relación de manuscritos de la biblioteca de este archivero e historiador de Tudela, rica en obras de historia, arqueología, paleografía y cronología. Aunque Fernández es autor de la mayoría de los códices, en su biblioteca también se encuentran copias de manuscritos de otros códices, como, por ejemplo, del Fueros de Uclés realizada por el mismo Fernández en 1790, hoy custodiada en la Biblioteca Nacional, y que perteneció a Pascual de Gayangos.